Российские ученые первыми в мире научились читать геном ВИЧ на мини-секвенаторе

Определение нуклеотидной последовательности ДНК вируса позволит изучить вирусное разнообразие у пациентов для того, чтобы, например, точно определить устойчивость вируса к лекарственным препаратам.

Открытие сделали ученые Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Они применили аппарат секвенатор MinION , который уже несколько лет используется генетиками в сфере, в которой его еще не использовали. 

«До сих пор никаких публикаций по секвенированию ВИЧ именно с помощью этого прибора не было. И мы решили заполнить этот пробел. Геном ВИЧ с помощью MinION от начала до конца можно прочесть за один раз, что делает секвенатор исключительно полезным инструментом для изучения вирусного разнообразия у пациентов», — цитирует ТАСС руководитель научной группы разработки новых методов диагностики ВИЧ-инфекции Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Дмитрий Киреев.

На этом исследование возможностей прибора не закончилось. Теперь ученым предстоит узнать, насколько точно работает новый прибор, сравнив результаты секвенирования международного стандарта ВИЧ и клинического образца.

«От результатов исследования будет зависеть, смогут ли эпидемиологи России пользоваться этим инструментом для решения важных государственных задач, например, для быстрого и точного реагирования на вспышки инфекционных заболеваний», — прокомментировал Киреев.

Секвенатор третьего поколения похож на флешку и стоит чуть более 100 тысяч рублей, зато имеет неоценимую пользу:

«Подготовка к секвенированию занимает один-два часа, само секвенирование длится шесть часов, и в результате вы получаете данные прямо на экране компьютера. Причем можно делать это дома, в лаборатории, в поле с ноутбуком. <...>Генная диагностика становится доступной бытовому пользователю в домашних условиях. Уже скоро каждому человеку при рождении, а в некоторых случаях даже до рождения можно будет сделать этот анализ и узнать его геном»,— рассказал руководитель научной группы разработки новых методов диагностики на основе технологий NGS ЦНИИЭ Камиль Хафизов.

Если эксперимент пройдет успешно, прибор поступит в ЦНИИЭ и будет использоваться в "полевых условиях". Это будет, по мнению ученых, настоящим прорывом в области диагностики на месте.  

А ранее Пятый канал рассказывал, как пациенту в Краснодаре несколько лет ставили диагноз ВИЧ.